生物系研究者のpythonとか画像解析とか論文とか

主に生物系研究で使えるpythonとか画像解析とか論文の話とかをザックリ書きます

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venvで環境構築をする

最近までAnacondaで環境構築を行なっていたが、いくつか不便なことがあった。

例えば、 ・pipとの競合 ・プロジェクトごとに管理しにくい ・pyinstallerでexe化した時に肥大化する ・たまに壊れる などなど

特にpipとの競合は気を使うし 壊れた時は復旧が大変

そこで python3.3から使えるようになったvenvで環境構築することにした

ただし、この場合はpythonのversionが変更できないので、その時はpyenvと併用する必要があるかも。

以下メモ

プロジェクトディレクトリへ移動

python -m venv {環境名}

環境名はなんでも良いが、プロジェクトディレクトリに置くならvenvとかにしておくとわかりやすい 環境名のディレクトリが作成されるので

source {環境名}/bin/activate

で環境に入れる

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