生物系研究者のpythonとか画像解析とか論文とか

主に生物系研究で使えるpythonとか画像解析とか論文の話とかをザックリ書きます

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ImageJ (Fiji) で直線上の輝度を定量する (line profile)

画像上で直線上の輝度を定量したいことがあります

例えば細胞膜上にタンパク質が局在していることを示したい時とかですね

まず直線を書くツールを選択して定量したい位置に直線を引きます

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次に Analyze>Plot Profileを選択します。

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プロットを選んだ状態で File>Save As からプロット画像を保存できます

数値だけが欲しい場合は Listボタンを押して出てきた Plot Valuesをコピー&ペーストするか Data>Save Data でcsvファイルを保存できます

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