生物系研究者のpythonとか画像解析とか論文とか

主に生物系研究で使えるpythonとか画像解析とか論文の話とかをザックリ書きます

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ImageJでLSMファイルを開く

ImageJで顕微鏡ファイルを開く方法を紹介した。 mlwbio.hatenablog.com

LSMファイルについては別の専用プラグインがあるのでそちらの紹介

LSMToolbox

基本的にこちらを見ればわかる imagejdocu.tudor.lu

install

これをダウンロードして https://imagejdocu.tudor.lu/_media/plugin/inputoutput/lsmtoolbox/lsmplugins.zip 解凍して.jarを ImageJフォルダのPluginsフォルダ内に配置する ImageJを再起動して Plugins>LSM Toolbox から使える。

使い方

Plugins>LSM Toolbox>ShowLSMToolbox Open LSM で開きたいLSMファイルを選べば良い。 便利なのは Batch convert 複数のLSMファイルをまとめてTiff等に変換できる

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